Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBR3Q6ZT12 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms