Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COLCA1Q6ZS62 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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