Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms