Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED27Q6P2C8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms