Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms