Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms