Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms