Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms