Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms