Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM187BQ17R55 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms