Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HADHQ16836 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HADHQ16836 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HADHQ16836 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HADHQ16836 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HADHQ16836 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HADHQ16836 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HADHQ16836 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HADHQ16836 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HADHQ16836 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HADHQ16836 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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