Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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