Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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