Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ECM1Q16610 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ECM1Q16610 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ECM1Q16610 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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ECM1Q16610 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ECM1Q16610 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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ECM1Q16610 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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