Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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GABRA6Q16445 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA6Q16445 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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