Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NTRK3Q16288 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NTRK3Q16288 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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