Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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