Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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