Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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