Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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