Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms