Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RRP1BQ14684 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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RRP1BQ14684 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRP1BQ14684 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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