Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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