Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms