Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms