Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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GTF2H3Q13889 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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GTF2H3Q13889 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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GTF2H3Q13889 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GTF2H3Q13889 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms