Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms