Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR4Q13639 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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