Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CUL4AQ13619 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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