Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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