Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NEUROD1Q13562 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEUROD1Q13562 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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