Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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