Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TOP3AQ13472 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TOP3AQ13472 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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