Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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MKRN4PQ13434 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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MKRN4PQ13434 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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MKRN4PQ13434 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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