Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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