Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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