Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLD1Q13393 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PLD1Q13393 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLD1Q13393 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLD1Q13393 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD1Q13393 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms