Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms