Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RESTQ13127 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RESTQ13127 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RESTQ13127 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RESTQ13127 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RESTQ13127 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RESTQ13127 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RESTQ13127 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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