Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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