Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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GPS1Q13098 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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