Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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