Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSRP1Q08945 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms