Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDR1Q08345 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms