Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL16A1Q07092 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms