Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms