Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
REG3AQ06141 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms