Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A11Q02978 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms