Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PRCDQ00LT1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms