Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms